🧫 Microbio.icu

Lecture assistée des comptes rendus de microbiologie

Ce que fait cet outil

Un dossier de microbiologie
se lit en une page, pas en trente.

Les résultats arrivent un par un, dans l'ordre où le laboratoire les valide. La question du clinicien — qu'est-ce que ce patient a, et que reste-t-il d'actif ? — n'y trouve pas de réponse directe.

Collez l'export d'Orbis : l'outil réorganise ces comptes rendus en une frise, un statut de portage, des courbes de charge virale et deux rendus prêts pour le compte rendu d'hospitalisation. Il n'en produit aucun, n'interroge aucun serveur, et ne remplace pas la lecture du compte rendu original.

Ouvrir la démonstration Trois dossiers fictifs.
Sans compte, tout de suite.

Voir la démonstration

Pas encore de compte ? — l'ouverture des droits est faite à la main, après vérification.

Cette demande n'ouvre aucun accès immédiat. Elle est transmise pour validation ; vous serez prévenu lorsque votre compte sera activé. D'ici là, la démonstration vous est ouverte.

3 à 32 caractères, sans espace ni accent.

10 caractères au minimum.

Conditions d'usage

  • Cet outil est une aide à la lecture : le compte rendu du laboratoire fait foi.
  • Je vérifierai systématiquement dans Orbis tout élément que je reporterai dans un compte rendu d'hospitalisation.
  • L'interprétation des résultats, la décision diagnostique et la prescription relèvent de la seule responsabilité du clinicien.
  • Cette responsabilité ne saurait être reportée sur le présent outil ni sur son auteur.

Mot de passe oublié

Le serveur ne conserve aucun mot de passe — seulement son empreinte — et ne peut donc pas vous rappeler le vôtre. Il peut en revanche vous envoyer un lien temporaire pour en poser un neuf. Ce lien part vers l'adresse électronique enregistrée sur le compte, jamais vers une autre.

Le lien est valable une heure et ne sert qu'une fois.

La réponse est la même selon qu'un compte existe ou non : cette page ne renseigne personne sur les comptes ouverts.

01

Toute l'histoire microbiologique sur un axe de temps

Une ligne par nature d'examen, une pastille par jour : positif, en cours, négatif, annulé. On voit d'un coup d'œil ce qui a été prélevé, quand, et ce qui court encore.

L'infobulle donne l'antibiogramme, les commentaires du laboratoire et le texte brut d'Orbis : la vérification de ce que l'outil a fait de la donnée est toujours à un clic.

Frise chronologique : une ligne par type de prélèvement, une pastille colorée par jour
Frise chronologique — dossier de démonstration
02

Le portage BMR / BHRe, avec la preuve qui le fonde

Huit marqueurs — BLSE, carbapénémase et son type, ERV, SARM, Pseudomonas, ABRI, Candida auris — chacun avec le prélèvement, le germe et la date qui l'établissent.

Deux règles s'y tiennent sans exception : un portage acquis ne se lève jamais tout seul, et « non recherché » ne s'affiche jamais comme un négatif. Lever un portage est une décision d'hygiène, pas de logiciel.

Huit cartes de portage BMR/BHRe, positives en rouge, négatives en vert, non recherchées en pointillé
Portage BMR / BHRe — dossier de démonstration
03

Une charge virale se lit en courbe, pas en liste

Les quantifications d'une même cible réunies et datées, plusieurs cibles superposables, en log₁₀ ou en valeur rendue par le laboratoire.

Une valeur bornée (<2.6) reste marquée comme telle, marqueur creux et trait pointillé : ce n'est pas une mesure, et la courbe ne fait pas semblant. La suite chiffrée est écrite en toutes lettres sous le graphique — un graphique ne se colle pas dans un compte rendu, une phrase si.

Courbe de charge virale CMV en log10, quatre points datés dont un borné
Suivi quantitatif des PCR — dossier de démonstration
04

Plusieurs antibiogrammes côte à côte

Les molécules rangées par famille, une colonne par isolat, avec le germe, ses mécanismes de résistance, la date et le prélèvement en tête. Les molécules discordantes ou sensibles partout ressortent d'un réglage.

Sert à vérifier qu'il s'agit bien de la même souche, ou à voir ce qui reste commun à plusieurs. Un · signifie « non testée » — jamais « résistante ».

Tableau comparant deux antibiogrammes molécule par molécule
Comparaison d'antibiogrammes — dossier de démonstration

Et deux rendus faits pour le compte rendu d'hospitalisation

📋 Rendu chronologique

Le dossier mis en forme pour être collé dans un CRH : une ligne par examen, antibiogrammes en liste, codes à trois lettres et légende. Pensé pour survivre au copier-coller — aucun tableau, aucune mise en forme qui se perde en chemin.

🧾 Synthèse par germe

Une entrée par espèce plutôt que par date : ses isolements successifs, le dernier antibiogramme rendu, ce qui reste actif, et les résistances acquises entre le premier et le dernier isolat — ce qui justifie un changement de traitement.

Comment cela s'utilise

  1. Sélectionner dans Orbis la partie du dossier qui contient les comptes rendus de microbiologie, et la copier. Voir le mode d'emploi ↗
  2. Coller dans la zone « Données brutes ». L'analyse se déclenche toute seule.
  3. Naviguer librement entre la frise, le rendu chronologique et la synthèse : le texte suit d'une page à l'autre. On colle une fois.

Ce qu'il faut savoir avant de s'en servir

  • C'est une aide à la lecture, pas une source. L'outil réorganise des résultats déjà validés par le laboratoire. Le compte rendu original fait foi, et une double vérification s'impose sur tout ce qui est reporté dans un dossier.
  • Il ne prescrit rien. Les seuils rappelés, les statuts de portage et les comparaisons d'antibiogrammes sont des aides à la lecture. L'interprétation, le diagnostic et la prescription relèvent du seul clinicien.
  • Les comptes sont nominatifs. Les pages affichent des résultats de patients : l'accès est ouvert un compte à la fois, après vérification, et se retire de la même façon. Les identifiants ne se partagent pas.
  • Aucune donnée nominative n'est enregistrée — ni nom, ni date de naissance, ni identifiant patient. Le texte collé reste dans l'onglet du navigateur et disparaît à sa fermeture.

Ouvrir la démonstration

Aide à l'analyse — la décision demeure clinique. Cet outil réorganise des résultats déjà validés par le laboratoire : il ne produit aucune donnée nouvelle et ne se substitue ni au compte rendu original ni au jugement du médecin. Les rapprochements qu'il propose — rappel des seuils usuels, statuts de portage, comparaison d'antibiogrammes, suivi de charge virale — sont des aides à la lecture et ne valent en aucun cas prescription. L'outil ne suggère aucune molécule ni aucune conduite thérapeutique.

L'interprétation des résultats, la décision diagnostique et la prescription relèvent de la seule responsabilité du clinicien, qui les fonde sur les comptes rendus originaux du laboratoire et sur le contexte clinique du patient. Cette responsabilité ne saurait être reportée sur le présent outil ni sur son auteur, dont la responsabilité ne peut être engagée à raison de l'usage qui en est fait ni des conséquences d'une décision prise sur la seule foi de cet affichage.

Aucune donnée nominative n'est enregistrée : ni nom, ni date de naissance, ni identifiant patient. En cas d'anomalie d'analyse, le compte rendu concerné est journalisé pour correction, numéro d'échantillon retiré.

© Florian Blanchard — Réanimation Gaston Cordier, Pitié-Salpêtrière · Contact